按照贵公司两个系统的使用情况来看，空调自控系统主要用于机组的控制和温湿度风量调节，环境监视系统主要用于关键生产房间的温湿度、压差、粒子等监视并打印放行记录。两个系统都属于关键GXP系统，它们两个是相互依托的，并不能简单的说哪一个系统更为关键。
BMS控制空调机组风量及温湿度调节，它直接影响EMS系统采集的关键房间的温湿度、压差数据，因此，BMS可以看做是给EMS提供“公用工程”，在此公用工程条件下，达到最终需要的放行环境条件。
但是，需要注意的是，若BMS和EMS共用的一套系统，或者有共用的传感器或控制器等情况，则需另当别论了。
理由：
BMS与EMS系统功能作用。
EMS系统用于数据的生成，处理及记录，并用于法规部门的监管。BMS系统用于在系统生命周期内的关键参数控制或者关键数据控制。
参考：
GAMP 5良好自动化生产实践指南
