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对于原料药来说，杂质来源有工艺杂质和降解产物，杂质研究需结合原料药具体的工艺以及产品的特点开展研究。原料药生产工艺发生变更后，产品中所含有的杂质情况可能会发生改变，杂质研究就需要根据变更后所采用的具体工艺展开相应的研究工作。杂质检测方法缺乏针对性指的就是没有基于具体的制备工艺对产品进行杂质研究，如未考察终产品与反应过程中所使用的原材料及其引入的杂质、所生成的中间体和副产物的分离度和检测灵敏度等。
如果中国药典收载有该产品的杂质检测方法，在不能确认在研产品所采用的制备工艺与药典标准一致时，不可简单的套用药典标准方法，还需进行全面、系统的方法学验证。如研究结果显示药典标准方法适用于在研产品，那么可以采用药典标准的方法；如研究结果显示不适用，则需按照有关的技术指导原则重新建立杂质检测方法。
